北京國家會計學院是國務院于1998年7月20日批準成立的國務院事業單位，由財政部代管，教學管理依托清華大學。
學院面向全國的培養宏觀經濟管理部門、國有大中型企業、金融機構和社會中介機構的高級管理人才及高級財會人才的會計和審計后續教育培訓基地。同時，學院和清華大學聯合培養總會計師方向工商管理碩士（MBA）和在職會計碩士(MPAcc)專業學位研究生教育。學院與清華大學聯合招收研究生692名，其中總會計師方向工商管理碩士（MBA）147人，會計碩士（MPAcc）專業學位生545名。目前，相當比例的畢業生在大型企業和會計師事務所發揮骨干作用。
2011年2月，國務院學位委員會批準北京國家會計學院成為碩士專業學位授予單位，2012年開始招收全日制會計碩士（MPAcc）、審計碩士（MAud）專業學位生。
北京國家會計學院實行董事會領導下的院長負責制，董事會由財政部、中央組織部、國家發展與改革委員會、國務院國有資產監督管理委員會、商務部、教育部、人事部、中國人民銀行、審計署、國家稅務總局、中國證監會、中國銀監會、北京市人民政府、上海市人民政府、福建省人民政府、廈門市人民政府、上海市財政局、廈門市財政局、清華大學、廈門大學、上海財經大學等組成。董事會主席由財政部部長擔任。
北京國家會計學院具備良好的教學設施、教學環境，為開展會計和審計碩士專業學位教育提供了良好辦學條件。學院（一期）占地面積200畝，建筑面積7萬多平方米，可同時容納1200多人同時培訓上課，二期工程占地面積150畝（正在建設過程中）。學院擁有一流的現代化教學、管理、信息、服務等基礎設施，擁有中外文專業圖書18,000冊、電子圖書210,000冊、專業期刊報紙200余種、專題數據庫11個，建有寬帶信息網絡系統，提供各種信息環境和多媒體教學環境，提供多種遠程教學手段，是一個典型的數字化園區。
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